免疫细胞在体内平衡和疾病中的功能
美国弗雷德哈钦森癌症研究中心 研究助理 采访实录
在对免疫学前沿科学家的持续报道中,我们很荣幸地采访了美国弗雷德哈钦森癌症研究中心Prlic实验室的研究助理Floran Mair。 弗洛里安一直致力于区分人类肿瘤独特的改变和非恶性组织炎症。 在这次采访中,他向我们讲述了他的工作、新技术的作用以及他对免疫学未来的展望。
1. 告诉我们一些关于你本人和你的学科兴趣。
我的主要兴趣是在人体组织的免疫稳态和疾病过程中,免疫细胞的功能是如何调节的。 在现存的的许多不同的免疫细胞群中,我最感兴趣的是树突状细胞(DCs)与效应T细胞和调节性T细胞之间的相互作用。 此外,我喜欢利用新技术和计算数据分析方法来更详细地探索这些单元的惊人复杂性。
2. 你能告诉我们一些关于结合流式细胞术和其他技术(如单细胞多组学)可以获得的见解吗?
当使用人体组织样本时,这些样本的大小几乎总是非常有限。 因此,我们必须利用技术,从有限数量的细胞中获得尽可能多的了解。 将高维流式细胞术与多组单细胞RNA测序(scRNA-seq)相结合是目前实现这一目标的最佳方法之一。 例如,多组scRNA-seq的一个优点是可以基于转录本表达进行无偏聚类,然后将产生的细胞簇映射回特定的表面蛋白表型,这可以用于设计下游的排序实验。
3. 在您最近的网络研讨会上,您介绍了RNA序列分析作为最后一步。 你如何跟进这些发现?
如前所述,我认为对转录组的探索性分析只是这个过程中的一步。 作为一个科学团体,我们需要做后续研究,在额外的体外实验中探索新发现的细胞表型。例如,用细胞因子刺激,TCR信号等。
4. 你对免疫学未来的展望是什么? 您能否介绍一下免疫学研究的发展方向、热点、趋势等?
我认为一个热门话题是将所有这些高维技术推进到空间维度,即能够直接查看组织内细胞的转录组和表面蛋白表型,而不需要隔离。 此外我认为,随着高维单细胞分析的成本继续下降,在个性化医疗和免疫监测的背景下,有潜在的巨大机会。 对于所有这些,我们需要高级的(但易于使用的)计算分析方法来帮助我们理解这些复杂的数据。
受访者所表达的观点是他个人的观点。
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