SARS-CoV-2病毒感染呈现一系列临床症状，从轻微症状或无症状到中度到重度呼吸系统疾病，如ARDS（急性呼吸窘迫综合征）和多器官衰竭，直至死亡。身体先天免疫防御涉及模式识别受体（PAR），它通过信号转导途径激活转录因子阵列，最终导致不同干扰素和趋化因子的分泌。后天免疫应答随之而来，形成保护，或如果不受控制，导致严重感染，促炎细胞因子释放增加（细胞因子风暴）。这些免疫应答的性质以及个体间有差异的原因仍不明确。

深层免疫分析技术提供了对个体免疫应答性质的透彻理解，可用于揭示个体应答的所有差异，并将这种多样性与疾病的临床模式、严重程度和进展相关联。高维流式细胞仪技术是一种强大技术，通过它可以更深入地了解免疫应答的确切性质和多样性。

在《新冠患者的深层免疫分析揭示了具有治疗意义的不同免疫类型》一文中，Mathew等人使用高维流式细胞仪来了解新冠患者免疫状况的一般分布（n=~125），研究了每种免疫状况的免疫特征。通过这项观察性研究，他们发现了几种模式：

• 与健康供体（HD）和康复供体（RD）相比，新冠患者的B细胞和CD3+ T细胞频率显著降低。与CD4 +T细胞相比，CD8 +T细胞损失更多。
  
• 高维流式细胞仪分析显示了淋巴细胞激活和分化的差异。
• 在新冠患者的一个亚群中，CD8 +T细胞激活是由KI67+和HLA-DR+CD38+非初始CD8 +T细胞的显著增加引起的。
• 感染也导致多种CD4+ T细胞应答。高维tSNE分析确定了新冠患者中激活的不同CD4群体。
• 在某组患者中，新冠患者之间的细胞因子水平（例如CXCL10）也存在差异，而其他没有表现出任何增加。
• 在新冠患者中观察到不同的B细胞群体，它们在若干表面标记物表达方面与健康供体和康复供体的表型不同
• 在新冠患者和HD群体与RD群体中，初始B细胞群体频率具有可比性，而类别转换（IgD-CD27+）和非类别转换（IgD+CD27+）记忆B细胞群体频率降低；相反，CD27 IgD-B细胞和CD27+CD38+浆细胞群体显著增加。
• 各新冠患者的浆细胞应答也不同。
• 在非初始CD8+ T细胞、非初始CD4+ T细胞和B细胞中，发现免疫应答与疾病进展有稳定的时间关系。
• 计算分析显示不同的免疫群体可能与疾病的严重程度有关。
• 强大的CD4 +T细胞激活、cT_FH细胞减少或缺乏和增殖效应器或耗尽CD8 +T细胞和T-bet+浆细胞，这些现象与更严重的疾病相关。
• 效应器CD8+ T细胞应答更常规、CD4 +T细胞激活减少、增殖浆细胞和记忆B细胞，这些现象与患者未能产生强大的T细胞和B细胞应答相关。

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