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      BD Rhapsody™ Express Single-Cell Analysis System

      パワフルでハイスループットなマイクロウェル・シングルセル単離システム

      Overview 特徴 PERFORMANCE APPLICATIONS

      Overview

      BD Rhapsody™Express シングルセル解析システムは、独自の細胞に優しいマイクロウェル単離技術を用いて数百から数千ものシングルセルをキャプチャーしバーコード化することでゲノム及びプロテオミクス解析を可能にします。

      BD Rhapsody™Expressシングルセル解析システムは、各単離ステップのQCイメージやトラブルシューティングを必要としないようなシングルセル解析に慣れているお客様に最適なシステムです。

       

      さらなる情報はBD Rhapsody™ Express System brochure.から

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      特徴

      BD Rhapsody™ Expressシングルセル解析システムはパワフルなマイクロウェルベースのシングルセル単離システムです

      • 液体ポンプを使用しない、小型のベンチトップ・シングルセル単離システム
      • 重力による自然落下によるマイクロウェルへの単離により細胞に優しい処理が可能
      • 各BD Rhapsody™カートリッジには、220,000を超えるパーティションを持つマイクロウェルアレイが含まれています
      • BD Rhapsody™カートリッジの容量は約600µLです。 希釈細胞懸濁液は、少量に濃縮することなく、カートリッジに直接ロードできます
      • マイクロ流体チャネルを使用していないため、チャネルが細胞で詰まる心配はありません
      • マイクロウェルは、細胞が表面に付着するのを防ぐために特殊な加工がされていて、しっかりとQCが実施されています

      BD Rhapsody™シングルセル解析システム用の安定した磁気バーコードビーズにより、柔軟な実験計画を立てることができます

      • BD Rhapsody™ビーズはワークフロー全体を通して安定しています
      • cDNA分子を含むビーズは数ヶ月間保存することができます
      • ビーズは、複数のシーケンス・ライブラリを作成するために分けてご使用いただけます
      • 保存されたビーズは実験を効率化できるようにプールして同時にシーケンスできます
      • 容易に共同研究者と保存されたビーズを共有することができます
      • パフォーマンスの標準化とSOP改善に役立ちます

      最大１２週間保存されたビーズから得られたデータによる遺伝子発現の高い相関と最小限のバッチ効果。

      BDRhapsody™シングルセル分析システムは、トランスレーショナル・リサーチ、多施設、大規模コホート研究に適したシステムです

      マイクロ流路技術を使用しないため、自然重力による優しい細胞単離が可能になり信頼性と再現性に優れた結果を得られます

      • Technical replicates結果で最小限のバッチ効果
      • Biological replicates結果で最小限のバッチ効果
      • サイト間のばらつきを最小限に抑える
      • ユーザー間のばらつきを最小限に抑える
      • 最小サンプルバイアス
      • バッチ効果を修正せずに大規模なデータセットを統合する機能

      Technical ReplicatesとBiological Replicates間、およびユーザーとサイト間で見られる遺伝子発現の高い相関。

      PERFORMANCE

      BDRhapsody™シングルセル解析システムは、信頼性と再現性のある結果を提供し、トランスレーショナル・リサーチに理想的なシステムです。

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      このシステムは、他のシステムと比較して、さまざまな細胞タイプで優れた細胞キャプチャー率と低いマルチプレット率を可能にします

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      カートリッジ間での全てのmRNAとタンパクマーカーの高い相関

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      同様なBiological replicatesデータ

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      サブサンプリングされたビーズからの同等のデータ

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      サブサンプリングされたビーズでWTAまたはターゲット解析した場合、同様な細胞タイプの割合が示されています

      Overview
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      Overview

      The BD Rhapsody™ Express System enables single-cell capture and barcoding of hundreds to thousands of single cells for analysis of genomic and proteomic information, using proprietary, gentle, robust microwell-based single-cell partitioning technology. The BD Rhapsody™ Express System can be used for lower scale experiments or throughput needs versus the NEW BD Rhapsody™ HT Xpress System, our NEW platform for flexible and scalable experimental design and higher throughput cell and sample inputs. The BD Rhapsody™ Express System is also ideal for routine use with familiar cell systems that do not require visual QC or troubleshooting.

       

      Get more information from the BD Rhapsody™ Express System brochure.

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      Features

      The BD Rhapsody™ Express System provides powerful microwell-based single-cell partitioning

      • Minimal set of benchtop equipment, no fluidic pumps
      • Allows gentle treatment of cells as they settle into microwells by gravity
      • Each BD Rhapsody™ Single-Lane Cartridge contains a microwell array with >220,000 partitions
      • The BD Rhapsody™ Single-Lane Cartridge has a volume ~600 µL; dilute cell suspensions can be loaded directly into the cartridge without needing to concentrate them into very small volumes
      • No microfluidic channels are involved so clogging of channels with cells is less of a concern
      • The microwells are specially treated to prevent cells from adhering to surfaces and extensive QC is performed

      Stable magnetic barcoded beads used with the BD Rhapsody™ System can be retained for later experimentation allowing for flexibility with experimental design

      • BD Rhapsody™ Enhanced Cell Capture Beads remain intact throughout the workflow
      • Beads with cDNA molecules can be stored for several monthss
      • Beads can be subsampled for creation of multiple sequencing libraries
      • Archived beads can be pooled and sequenced together for operational efficiency
      • Archived beads can be shared easily with research partners
      • Archived, subsampled beads can help standardize performance and develop SOPs

      High correlation in gene expression and minimal batch effects seen in data obtained from beads stored up to 12 weeks.

      The BD Rhapsody™ Express System is the ideal choice for translational, multi-center, multi-cohort studies

      Reliable, reproducible results from gentle, gravity-based single-cell partitioning without microfluidics

      • Minimal batch effects with technical replicates
      • Minimal batch effects with biological replicates
      • Minimal site-to-site variability
      • Minimal user-to-user variability
      • Minimum sample biasinimum sample bias
      • Ability to integrate large data sets without correction for batch effects

      High correlation in gene expression seen between technical and biological replicates and between users and sites.

      Performance

      The BD Rhapsody™ Single Cell Analysis System provides reliable and reproducible results making it an ideal system for translational studies.

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      The system offers superior cell capture rates and low multiplet rates with a variety of cell types as compared to other systems

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      Strong correlation of all mRNA and protein markers identifies similar T-cell populations between cartridges

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      Equivalent data from biological replicates

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      Equivalent data from subsampled beads

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      Similar proportions of each cell type are recovered from WTA and targeted analysis on subsampled beads


       

      Applications

      The BD Rhapsody™ Single-Cell Analysis System enables simultaneous measurement of surface proteins and mRNA expression, facilitating the identification of distinct subsets of regulatory T cells

      Differential gene expression and differential protein expression analysis were performed on three main Treg subsets identified based on manual gating and bivariate analysis of CD45RA and HLA-DR sorted Treg samples. Differential gene expression analysis was performed using the BD Rhapsody™ Targeted Human Immune Response Panel (399 genes). Upregulated genes (>1.25X) are shown in the heat map above. Differential protein expression of 22 proteins was performed simultaneously using BD® AbSeq Oligo-Conjugated Antibodies.

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      The BD Rhapsody™ Single-Cell Analysis System can be used for deep characterization of exhausted T cells

      Expression of 12 proteins and genes that are significantly upregulated at day 14 of chronic simulation of CD8+ T cells. Two populations (red and green boxes) emerged based on the expression level of markers. Co-expression patterns were discerned for CD38, CD39 and CD94. 

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      The BD Rhapsody™ Single-Cell Analysis System enables resolution of innate lymphoid cell heterogeneity

      Differential protein and gene expression at the single-cell level. Heterogeneity was observed in major ILC subsets.

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      The BD Rhapsody™ Single-Cell Analysis System enables identification of heterogeneity within CLL samples

      Clusters are well defined using simultaneous mRNA and protein analysis. Samples from healthy donors cluster similarly. CLL samples cluster separately and uniquely. 

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      BD Rhapsody™ Express Single-Cell Analysis System

      A powerful, high-throughput, microwell-based single-cell partitioning system

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      Videos
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      Counting Cells with the BD Rhapsody Single-Cell Analysis System
      Capturing Single Cells with the BD Rhapsody Express Single-Cell Analysis System
      Single-Cell Labeling with BD AbSeq and BD Single-Cell Multiplexing Kit
      One Workflow: Cell Enrichment to Single Cell Transcriptome and Proteome Analysis
      BD Rhapsody Single-Cell Analysis System Post PCR1 Purifications
      Performing Quality Control on the Final Sequencing Libraries
      BD Bioinformatics Pipelines
      APPLICATIONS

      BD Rhapsody™シングルセル解析システムは表面タンパク質とmRNA発現を同時測定することで、制御性T細胞の異なるサブセットの識別を可能にします

      CD45RAおよびHLA-DRでソートされたTregサンプルの手動ゲーティングおよび二変量解析に基づいて特定された3つの主要なTregサブセットに対し、差次的遺伝子発現および差次的タンパク質発現解析をした。遺伝子発現解析には、BD Rhapsody™Targeted Human Immune Response Panel（399遺伝子）を使用した。高発現した遺伝子(>1.25X)はヒートマップに示されている。

      BD®AbSeqオリゴ・コンジュゲート抗体を使用して、22種類のタンパク質発現も同時に解析された。

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      The BD Rhapsody™ シングルセル解析システムを用いた疲弊T細胞の特性評価

      CD8 + T細胞への慢性的刺激の14日目に有意義に高発現した12種のタンパクおよび遺伝子発現を示すヒートマップ。2つの細胞集団（赤と緑のボックス）が確認された。

      CD38, CD39 , CD94において共発現が認められた。

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      BD Rhapsody™シングルセル解析システムで、自然リンパ球の不均一性を解明

      シングルセルレベルでのタンパク質および遺伝子発現の差異を示すヒートマップ。主要なILCサブセットに不均一性が示されている。

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      BD Rhapsody™シングルセル解析システムでCLLサンプル内の不均一性を特定

      mRNAとタンパク質の同時解析により詳細な細胞集団クラスターが示されている。健康なドナーからのサンプル間でも同様なクラスターが示され、CLLサンプルではそれぞれに特有なクラスターが確認された。

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      BD Rhapsody™ Express Single-Cell Analysis System

      パワフルでハイスループットなマイクロウェル・シングルセル単離システム
      見積の依頼
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      For Research Use Only. Not for use in diagnostic or therapeutic procedures.

      Results shown are not guaranteed and may not be representative.

      Dynabeads is a trademark of Thermo Fisher Scientific.

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